《秒速5公分》這部電影由三個故事組成，串聯成長的苦澀與現實的變幻不居。 時間是1990年代的日本，遠野貴樹與篠原明里原本是同班同學的好朋友，自從小學畢業之後，兩人就都沒有再見過面。兩人即使分隔兩地，依舊靠著書信往來保持聯絡。

某天，當貴樹知道自己即將跟隨家人搬到鹿兒島，搬到離明里更遠的地方後，兩人於是約定要再次見面。

但是兩人原本計畫好的行程，卻遇上了暴風雪…。

第一篇「櫻花抄」描述貴樹和明里的重逢之日，第二篇「太空人」以不同人物的觀點描述在那之後的貴樹，第三篇與本作品的片名同為「秒速5公分」，探討貴樹與明里兩人靈魂的徬徨猶豫。

《秒速5公分》是新海誠與其團隊以高度感性製作、獨樹一格的抒情詩。片名《秒速5公分》指的是櫻花飄零散落的速度，用以暗喻少年夢想的失落與徬徨，新海誠並不模仿宮崎駿，他開創自己獨特的風格，不論他是否真是宮崎駿的接班人，令人肯定的是，年僅34歲的他是日本動畫界的新希望，《秒速5公分》已經足以展露他蘊藏的大師潛力。 《秒速5公分》是敘述一對戀人因「距離」而引發的情愫，由「櫻花抄」、「太空人」和「秒速5公分」三個短篇串聯成一部前呼後應的精彩電影。在短短的六十分鐘內，我們就進入了兩個主角的人生，並且聯想到自己的生長過程：由天真童稚時代，到酸澀難懂的青春期，再到無奈的成人世界，「動畫界新秀」新海誠這部新作實令人驚?。 這部作品是新海誠繼《雲之彼端，約定的地方》之後的第四部作品，有別於他之前的作品風格，沒有任何科幻或脫離現實的要素存在，在這部新作品中，新海誠用一個平凡的故事來切割真實世界，並將由小而逐漸擴大的情意從電影螢幕上傳遞到每個觀眾的心中。

全片滿溢著真實的情感，由初萌芽到濃烈，繼而轉淡，就如旁白所言：一切都是因為懷著惡意的時間，沖刷掉所有已成型或正在成型的事物或感情，剩下只有變動與不安。片中火箭升空的場面也反映出人在宇宙中的渺小，只能繼續往未知的未來前進。新海誠巧妙地運用時空交錯的手法，讓情感忽遠忽近的在片中亂竄，片尾的結局若有似無，讓人有幾絲無奈之感。

這部動畫吸引人的地方不在於強烈的聲光效果，新海誠延續他前作《雲之彼端，約定的地方》中既寫實又精緻的畫風。小到火車上的地板，大到全景的天空、浩氣的雲層、升天的火箭，一一都是絢爛動人而逼真的畫面。在時間的主軸下，《秒速5公分》中所挾帶的情感，隨著時序變換而有了不同的氣味，我們在其中也聞到了專屬於自己的記憶香味。